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顶尖高手论坛科研处正式成立于2001年9月，是顶尖高手论坛的科研管理部门, 在主管校长的领导下工作。成立初期下设项目管理科和成果管理科两个科室。2007年8月，增设了综合科。2011年9月，调整为社会科学科、自然科学科、学科建设管理科和研究生培养办公室四个科室。现有工作人员七人，负责全校科学研究等日常组织管理工作。
科研处
生物分子识别与传感重点实验室
豫鲁苏皖接合区经济社会发展研究中心
汉梁文化研究中心
庄子与道家文化研究中心
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